O Setor de Mapoteca da Biblioteca Central do CCMN foi criado em 1981 originando-se do acervo da antiga Biblioteca do Instituto de Geociências. Seu acervo atualmente tem cerca de 2221 registros incluindo cartas topográficas e geológicas, mapas (especiais, temáticos e gerais), atlas, CD-ROMs e textos explicativos. A consulta local ao acervo é livre para a comunidade interna e externa da UFRJ, não sendo permitidos empréstimos domiciliares.